Той е проектиран от британско-иракския архитект Заха Хадид - първата жена, която печели престижната награда „Pritzker Architecture Prize” и ще бъде дизайнер на центъра по водни спортове за олимпиадата в Лондон през 2012 г.

От външната страна, музея изглежда като широка структура, която се разширява хоризонтално, а не вертикално. Построен е извън историческия център на града на мястото на разрушени военни бараки в кв. „Фламинио” (Flaminio), като по този начин са избегнати протести относно стила на сградата, който се различава от този на големите художествени съкровища на Рим. Всъщност архитектите даже са похвалени за внасянето на свежи и нови форми в Рим.

Г-н Балди обобщи културната мисия на музея в три думи: иновации, културното многообразие и интердисциплинарност.